Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms