Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG0

Gm9008, Predicted pseudogene 9008, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9008E9PVG0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9008E9PVG0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9008E9PVG0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms