Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc62E9PVD1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc62E9PVD1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms