Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc175E9PVB3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms