Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifit3bE9PV48 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifit3bE9PV48 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms