Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syde2E9PUP1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syde2E9PUP1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms