Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm5478D3Z6R0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5478D3Z6R0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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