Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms