Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
5430403G16RikD3Z5L4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms