Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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