Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ5

Tmed7, Transmembrane p24-trafficking protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed7D3YZZ5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed7D3YZZ5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms