Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc8D3YZV8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms