Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif28pD3YXS5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kif28pD3YXS5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms