Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc170D3YXL0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms