Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SafbD3YXK2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SafbD3YXK2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms