Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm4950D3YUM8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm4950D3YUM8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm4950D3YUM8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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