Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nxpe3B9EKK6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxpe3B9EKK6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms