Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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