Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11bB4XVQ1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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