Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cyp26c1B2RXA7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cyp26c1B2RXA7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cyp26c1B2RXA7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cyp26c1B2RXA7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cyp26c1B2RXA7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cyp26c1B2RXA7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cyp26c1B2RXA7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cyp26c1B2RXA7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cyp26c1B2RXA7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cyp26c1B2RXA7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cyp26c1B2RXA7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cyp26c1B2RXA7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cyp26c1B2RXA7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cyp26c1B2RXA7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cyp26c1B2RXA7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cyp26c1B2RXA7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp26c1B2RXA7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms