Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Abcc8B2RUS7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc8B2RUS7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Abcc8B2RUS7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Abcc8B2RUS7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Abcc8B2RUS7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Abcc8B2RUS7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Abcc8B2RUS7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Abcc8B2RUS7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Abcc8B2RUS7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Abcc8B2RUS7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Abcc8B2RUS7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Abcc8B2RUS7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Abcc8B2RUS7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Abcc8B2RUS7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Abcc8B2RUS7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Abcc8B2RUS7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Abcc8B2RUS7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Abcc8B2RUS7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc8B2RUS7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc8B2RUS7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc8B2RUS7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc8B2RUS7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc8B2RUS7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc8B2RUS7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc8B2RUS7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms