Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AU015836B2RUM3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AU015836B2RUM3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AU015836B2RUM3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AU015836B2RUM3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AU015836B2RUM3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AU015836B2RUM3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AU015836B2RUM3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AU015836B2RUM3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AU015836B2RUM3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AU015836B2RUM3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AU015836B2RUM3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AU015836B2RUM3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AU015836B2RUM3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AU015836B2RUM3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AU015836B2RUM3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AU015836B2RUM3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
AU015836B2RUM3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AU015836B2RUM3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AU015836B2RUM3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AU015836B2RUM3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AU015836B2RUM3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AU015836B2RUM3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AU015836B2RUM3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AU015836B2RUM3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AU015836B2RUM3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AU015836B2RUM3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms