Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms