Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprbB2RU80 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprbB2RU80 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms