Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrn3B2RS91 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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