Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf518bB2RRE4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf518bB2RRE4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms