Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC035947B2RQY6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms