Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf3B2RQG2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms