Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zbed5B2RPU8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms