Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn7aB1AYL1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn7aB1AYL1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Scn7aB1AYL1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms