Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms