Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms