Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint4A7TZF3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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