Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc38A3KMP2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc38A3KMP2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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