Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms