Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl41A2AUC9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl41A2AUC9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms