Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ism1A2ATD1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ism1A2ATD1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ism1A2ATD1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ism1A2ATD1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ism1A2ATD1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ism1A2ATD1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ism1A2ATD1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ism1A2ATD1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ism1A2ATD1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms