Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pramef25A2ASI9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms