Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtf1A2AQ19 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms