Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms