Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cavin4A2AMM0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms