Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SetxA2AKX3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SetxA2AKX3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms