Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms