Protein–RNA interactions for Protein: A2AIX1

Sec16a, Protein transport protein sec16, mousemouse

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16aA2AIX1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec16aA2AIX1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec16aA2AIX1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec16aA2AIX1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec16aA2AIX1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec16aA2AIX1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms