Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin3aA2AIR5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms