Protein–RNA interactions for Protein: A2AHJ4

Brwd3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brwd3A2AHJ4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brwd3A2AHJ4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brwd3A2AHJ4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms