Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ckap5A2AGT5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ckap5A2AGT5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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