Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Frmpd4A2AFR3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms