Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930447F04RikA2AFR2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms