Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem185aA2AF53 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms